Sebastian Schipper wurde am 8. Mai 1968 in Hannover geboren. Nach dem Abitur studierte er von 1992-1995 Schauspiel an der Otto Falckenberg Schule in München. Schipper arbeitete an den Münchner Kammerspielen und hatte bereits während des Studiums ein Auftritt in Sönke Wortmanns Kinokomödie "Kleine Haie" (1992).

Als Filmschauspieler spielte Schipper zunächst hauptsächlich Nebenrollen, darunter einen deutschen Soldaten in der US-Produktion "The English Patient". Unter der Regie von Tom Tykwer war Schipper in "Winterschläfer" (1997) und "Lola Rennt" (1998) zu sehen.

Mit "Absolute Giganten" brachte Sebastian Schipper 1999 sein Spielfilmdebüt als Regisseur und Autor in die Kinos. Co-Produzent für X-Filme war wiederum Tom Tykwer. Der von der Kritik hoch gelobte Film über drei jugendliche Freunde, die eine letzte gemeinsame Nacht in Hamburg verbringen, wurde vielfach ausgezeichnet, darunter mit dem Deutschen Filmpreis in Silber.

Es folgten weitere Zwischenspiele als Darsteller, etwa in Tykwers "Der Krieger und die Kaiserin" (2000), dem Boxerdrama "Elefantenherz" (2002) und Romuald Karmakars Berlinale-Wettbewerbsbeitrag "Die Nacht singt ihre Lieder" (2004), sowie mehrere Regiearbeiten für Werbefilme.

2006 präsentierte Schipper mit "Ein Freund von mir" dann seine zweite große Regiearbeit. Zwischen Komödie und Charakterstudie angesiedelt, schildert der Film – mit Daniel Brühl, Jürgen Vogel und Sabine Timoteo in den Hauptrollen – die innige Freundschaft zwischen zwei sehr ungleichen Männern und die Gefährdung der Freundschaft, da beide dieselbe Frau lieben.

Sebastian Schippers nächstes Projekt wurde 2009 auf der Berlinale vorgestellt: "Mitte Ende August", unter anderen mit Marie Bäumer und Milan Peschel in den Hauptrollen, ist eine Interpretation von Goethes "Wahlverwandtschaften" und erzählt von einer Handvoll Menschen, die während eines Sommers in einem Haus auf dem Land in Gefühlswirren gestoßen werden.