Clara Stella Hüneke wurde in Frankfurt geboren. Nach dem Abitur 2011 studierte sie Videokunst an der Hochschule Darmstadt. Während des Studiums sammelte sie 2014 praktische Erfahrungen als Regieassistentin bei Bernadette Knollers Kinofilm "Ferien". 2015 drehte sie ihren Bachelor-Film "Parko", einen Dokumentarfilm über einen kommerziellen Parkplatz in Athen, der während der Schuldenkrise 2008 von Nachbarinnen und Aktivistinnen zu einem belebten grünen Park umgestaltet wurde. Der 37-minütige Film wurde unter anderem in der Kunsthalle Wien und bei der Kyiv Biennale gezeigt.

In den folgenden Jahren arbeitete Hüneke als Junior Producerin bei Vice Germany, bevor sie 2018 ihr Regiestudium an der Filmakademie Baden-Württemberg in Ludwigsburg aufnahm. Im Rahmen ihres Studiums realisierte sie weitere Kurzfilme, unter anderem den siebenminütigen Animationsfilm "Auf bald, deine Clara", der auf mehreren internationalen Festivals lief. Ihr Diplom machte sie mit dem abendfüllenden Dokumentarfilm "Sisterqueens" über drei Berliner Mädchen zwischen neun und zwölf Jahren, die eine Hip-Hop-Band gründen. Der Film eröffnete die Sektion CineKindl beim Filmfest München 2024 und wurde beim Hessischen Filmpreis 2024 als Bester Dokumentarfilm nominiert. Der Kinostart war im März 2025.